Il Museo, fondato nel 1823 da Emanuele Barba, è una "Camera delle Meraviglie" con varie collezioni, tra cui fossili, armi, abiti e opere di Giovanni Andrea Coppola. Espone reperti archeologici, sarcofagi, vasi messapici, ritratti locali e una raccolta numismatica. Nel 2010, la sezione sulle patologie genetiche ha riaperto dopo dieci anni. Situato in un antico palazzo del 1800, il Museo si suddivide in tre sezioni: museo principale, biblioteca "Ex Sant'Angelo" e Sala Collezione Coppola.

L'Archivio Storico di Gallipoli si trova al piano terra dell'ex Oratorio dei Nobili, un magnifico edificio caratterizzato da un'elegante facciata con un'ampia scalinata a doppia rampa.

La Biblioteca Comunale si trova al primo piano dell'ex Oratorio dei Nobili, un magnifico edificio caratterizzato da un'elegante facciata con un'ampia scalinata a doppia rampa.

La preziosa Collezione Coppola, composta da 20 affascinanti tele, è un tributo all'arte di Giovanni Andrea Coppola, illustre medico e pittore originario di Gallipoli (1597-1659).

Il Museo ospita una sezione dedicata ai Cetacei, la piu’ importante raccolta presente in Puglia, con scheletri completi di Tursiope, Stenella, Grampoe Zifio, questi ultimi di notevole importanza scientifica e di estrema rarita’ nel panorama museale italiano.